Swissprot

Neste ponto de análise foi utilizada uma base de dados denominada por SWISSPROT composta apenas por registos curados. Uma vez que todos os conteúdos desta base de dados são revistos, estes adquirem uma maior fiabilidade. O objetivo deste scrip consiste em aceder à SwissProt, retirando algumas informações de interesse. Procedeu-se à verificação manual dos genes pertencentes à zona do genoma em estudo que contidos no registo da Swissprot. Conhecendo a identificação dos genes, utilizou-se a função get_sprot_raw() acedendo á base de dados. Para cada gene de interesse foi criado um objeto SwissProt.Record exportando as informações relevantes para o ficheiro swissprot.txt.

swissprot.txt (12988)

O código desenvolvido para a construção do script SWISSPROT.py encontra-se no link abaixo ua vez que foi impossível colocar o ficheiro no presente site.

  SWISSPROT.py